Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NXF1Q9UBU9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF1Q9UBU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF1Q9UBU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms