Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf48Q9UBA6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf48Q9UBA6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf48Q9UBA6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C6orf48Q9UBA6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C6orf48Q9UBA6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms