Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HCN3Q9P1Z3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HCN3Q9P1Z3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms