Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4Q9P0V3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4Q9P0V3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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