Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC59Q9P031 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC59Q9P031 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms