Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDE1Q9NZC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GDE1Q9NZC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDE1Q9NZC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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