Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms