Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DLL3Q9NYJ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms