Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NSMCE4AQ9NXX6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE4AQ9NXX6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE4AQ9NXX6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms