Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDKN2AIPQ9NXV6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN2AIPQ9NXV6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms