Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDE1Q9NXR1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDE1Q9NXR1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms