Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C2orf42Q9NWW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf42Q9NWW7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf42Q9NWW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms