Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PDS5BQ9NTI5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
PDS5BQ9NTI5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC40.06■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC40.06■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC40.01■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PDS5BQ9NTI5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC39.99■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
PDS5BQ9NTI5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms