Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TREX1Q9NSU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TREX1Q9NSU2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms