Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RRP7BPQ9NSQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRP7BPQ9NSQ0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms