Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB6BQ9NRW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms