Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf4Q9NR00 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf4Q9NR00 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms