Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF12AQ9NP84 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF12AQ9NP84 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms