Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK-5Q9HDB9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVK-5Q9HDB9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK-5Q9HDB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK-5Q9HDB9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms