Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN10Q9HC96 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN10Q9HC96 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN10Q9HC96 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms