Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARVBQ9HBI1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PARVBQ9HBI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms