Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REEP1Q9H902 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REEP1Q9H902 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REEP1Q9H902 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms