Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C10orf88Q9H8K7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C10orf88Q9H8K7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms