Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMP4BQ9H444 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHMP4BQ9H444 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms