Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC00597Q9H2U6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00597Q9H2U6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms