Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRMDAQ9H2I8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRMDAQ9H2I8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRMDAQ9H2I8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms