Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RSPH9Q9H1X1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPH9Q9H1X1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RSPH9Q9H1X1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSPH9Q9H1X1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSPH9Q9H1X1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSPH9Q9H1X1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RSPH9Q9H1X1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms