Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM49AQ9H0Q0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM49AQ9H0Q0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM49AQ9H0Q0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms