Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC113Q9H0I3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC113Q9H0I3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC113Q9H0I3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms