Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CFAP74Q9C0B2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CFAP74Q9C0B2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CFAP74Q9C0B2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms