Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMES1Q9C002 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NMES1Q9C002 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms