Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM6SF2Q9BZW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM6SF2Q9BZW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM6SF2Q9BZW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms