Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRNKL1Q9BZJ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRNKL1Q9BZJ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms