Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAPERQ9BY12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAPERQ9BY12 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
SCAPERQ9BY12 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms