Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC46A2Q9BY10 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC46A2Q9BY10 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC46A2Q9BY10 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms