Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SRRTQ9BXP5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRRTQ9BXP5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 531.1 ms