Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1QTNF3Q9BXJ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1QTNF3Q9BXJ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms