Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LSM14BQ9BX40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LSM14BQ9BX40 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM14BQ9BX40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms