Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SYCP2Q9BX26 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYCP2Q9BX26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYCP2Q9BX26 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms