Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DSCC1Q9BVC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSCC1Q9BVC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSCC1Q9BVC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms