Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP8Q9BV40 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VAMP8Q9BV40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP8Q9BV40 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms