Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTA3Q9BTC8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTA3Q9BTC8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTA3Q9BTC8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms