Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SDF4Q9BRK5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDF4Q9BRK5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms