Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
REEP2Q9BRK0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REEP2Q9BRK0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms