Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM4BQ9BQ04 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms