Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DUSP9Q99956 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUSP9Q99956 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms