Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN18Q99952 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN18Q99952 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms