Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RBBP8Q99708 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms