Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF11Q99590 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF11Q99590 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF11Q99590 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms