Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SORT1Q99523 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms